Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sike1Q9CPR7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Sike1Q9CPR7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sike1Q9CPR7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms