Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt23Q99PS0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt23Q99PS0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms