Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim8Q99PJ2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms