Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem2Q99NH8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms