Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b1Q99NB9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms