Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brms1Q99N20 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brms1Q99N20 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms