Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac9Q99N13 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdac9Q99N13 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms