Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd1Q99MV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tdrd1Q99MV1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms