Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp4Q99ME9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms