Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5rap3Q99LM2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms