Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms