Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pagr1aQ99L02 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms