Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TriobpQ99KW3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms