Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms