Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf11Q99JX1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf11Q99JX1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms