Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GatbQ99JT1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms