Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd2Q99JR8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd2Q99JR8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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