Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spef1Q99JL1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spef1Q99JL1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms