Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim11aQ99J19 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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