Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn16Q925N4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms