Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf144aQ925F3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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