Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms