Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim59Q922Y2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms