Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx15Q91WE1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms