Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc42ep1Q91W92 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms