Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csde1Q91W50 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csde1Q91W50 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms