Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn8Q91VA3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms