Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc115Q8VE99 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc115Q8VE99 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms