Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VDP2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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