Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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