Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn4Q8VCH8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn4Q8VCH8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms