Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1mtQ8R4U6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1mtQ8R4U6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms