Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms