Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8R3C1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms