Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C8

Vmn1r18, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r18Q8R2C8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r18Q8R2C8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r18Q8R2C8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms