Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms