Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OptnQ8K3K8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms