Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms