Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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