Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssh3Q8K330 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms