Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms