Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Phf13Q8K2W6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf13Q8K2W6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms