Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd3Q8K2C9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms