Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms