Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr3Q8K296 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtmr3Q8K296 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms