Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fcho1Q8K285 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms