Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms