Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1eQ8K202 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms