Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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