Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Card11Q8CIS0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Card11Q8CIS0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Card11Q8CIS0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms